Слово «вилы» в этом значении пришло из уголовного жаргона.

ВИЛЫ2, вил, мн. 1. Высшая мера наказания (смертная казнь). Ему дали вилы. 2. в зн. межд. Выражает тревогу, опасность, страх и т. п. вилы, милиция!

Возм. от уг. «вилы» — арест, угроза ареста.

Откуда вообще взялся этот жаргонизм? Тут можно только делать предположения, но версии довольно прозрачны. Очевидна отсылка к выражению «вздернуть на вилы», обозначающему наказание. Вилы — это оружие, которое можно приставить внезапно напавшему противнику к горлу или защищаться с помощью вил. Остаться невредимым, не пострадать от вил в такой ситуации довольно сложно, отсюда и жаргонное значение.